Krigen
Under krigen ble både Trondheim Sykehus og Røde Kors Klinikk drevet nesten som normalt fram til 1943. Da varslet de tyske okkupantene at sykehuset skulle brukes som marinelasarett.
Trondheim kommune fikk en avtale med Røde Kors om leie av tre etasjer med 114 senger i Røde Kors Klinikk på Øya. Hit ble kirurgisk avdeling flyttet. Resten av klinikken ble drevet av Røde Kors som før.
Den øvrige virksomheten ved Trondheim Sykehus ble drevet videre i Thomas Angells Hus og Trondhjems Hospital på Hospitalsløkkan.
På forsommeren 1945 ble Trondheim Sykehus overtatt av allierte styrker. Men først i september samme år kunne sykehuset igjen tas i sivilt bruk.